More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2098 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
290 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2158  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  91.29 
 
 
292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0339108  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.43 
 
 
299 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0132  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  80.15 
 
 
293 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2063  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  80.74 
 
 
273 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.56 
 
 
271 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334186  hitchhiker  0.000427033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.27 
 
 
271 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.27 
 
 
271 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.811587  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.56 
 
 
274 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.4 
 
 
270 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0237  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  47.52 
 
 
272 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
272 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404079  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7196  sulfate ester transporter permease protein  48.35 
 
 
261 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22530  ABC transporter inner-membrane protein  49.37 
 
 
257 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
258 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4841  ABC transporter permease  44.39 
 
 
260 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
266 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.534527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.04 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
532 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
536 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
275 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02340  putative permease of ABC transporter  40.36 
 
 
538 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00529429  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
260 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00657173  hitchhiker  0.00236959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  40.36 
 
 
538 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
528 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
534 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
564 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
533 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  37.13 
 
 
274 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  37.13 
 
 
274 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
528 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 
286 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
282 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  37.05 
 
 
272 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.13 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
285 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
279 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
537 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
286 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.63 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.96 
 
 
532 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
538 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.9 
 
 
279 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
286 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  34.84 
 
 
262 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  37.56 
 
 
528 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0133  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.65 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.744619  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
566 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0913088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
302 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  34.02 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2159  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  38.01 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514359  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
259 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  38.79 
 
 
286 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
276 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
289 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
279 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
275 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.62 
 
 
263 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.21 
 
 
293 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
265 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
265 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
279 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
283 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
279 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  31.25 
 
 
245 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
285 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
263 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.94 
 
 
279 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0236  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
280 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
264 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22520  ABC transporter inner-membrane protein  38.22 
 
 
277 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
264 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
265 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
272 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
259 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00307443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
264 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  31.84 
 
 
264 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
265 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
279 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.23 
 
 
279 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31.37 
 
 
279 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>