46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7300 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7300    100 
 
 		 562 bp  1114    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130484  hitchhiker  0.00884242 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  84.04 
 
 		 849 bp  67.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  84.04 
 
 		 849 bp  67.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  83.02 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  83.02 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2031    94.59 
 
 		 480 bp  58  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  96.97 
 
 		 852 bp  58  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 753 bp  58  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 762 bp  58  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 753 bp  58  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1091    94.59 
 
 		 966 bp  58  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    94.59 
 
 		 2253 bp  58  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 552 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  88 
 
 		 912 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    90.24 
 
 		 669 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  91.89 
 
 		 849 bp  50.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  90.24 
 
 		 888 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  90.24 
 
 		 888 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  90.24 
 
 		 888 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  90.24 
 
 		 888 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  90.24 
 
 		 888 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  90.24 
 
 		 690 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  90.24 
 
 		 888 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  91.89 
 
 		 849 bp  50.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  94.59 
 
 		 2325 bp  50.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1015    84.62 
 
 		 351 bp  50.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000847594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  94.59 
 
 		 2388 bp  50.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  94.59 
 
 		 2388 bp  50.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  94.59 
 
 		 2325 bp  50.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  90.24 
 
 		 891 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    90.24 
 
 		 669 bp  50.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  93.75 
 
 		 891 bp  48.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    91.67 
 
 		 124 bp  48.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>