26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6776 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
334 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  53.75 
 
 
344 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  53.17 
 
 
344 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  38.44 
 
 
332 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  30.06 
 
 
326 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  25.76 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  26.87 
 
 
236 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  29.66 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  32.8 
 
 
248 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  28.87 
 
 
185 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  30.61 
 
 
283 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  28.68 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  26.03 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  30.53 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  29.5 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  36.47 
 
 
227 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  26.76 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  31.69 
 
 
249 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  28.38 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  30.77 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  28.19 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  31.53 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  28.68 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>