More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4606 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  53.45 
 
 
232 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  52.59 
 
 
232 aa  234  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  51.72 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  51.72 
 
 
232 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  50.86 
 
 
232 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  50.21 
 
 
232 aa  224  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4936  Pirin-like  51.71 
 
 
235 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3224  pirin domain-containing protein  51.71 
 
 
235 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.911223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  50 
 
 
232 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  49.79 
 
 
232 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5536  pirin domain-containing protein  52.99 
 
 
235 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  49.36 
 
 
232 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  50.43 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  49.14 
 
 
233 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  48.28 
 
 
232 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  49.35 
 
 
243 aa  214  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  50 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5776  pirin domain-containing protein  51.28 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  47.64 
 
 
238 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  47.41 
 
 
232 aa  208  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  47.84 
 
 
233 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  47.21 
 
 
234 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  45.69 
 
 
232 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  47.44 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  45.49 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  46.35 
 
 
232 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  45.49 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  45.49 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  45.06 
 
 
232 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  45.06 
 
 
236 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  46.12 
 
 
232 aa  184  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  32.62 
 
 
236 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  35.19 
 
 
235 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  32.03 
 
 
253 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  34.03 
 
 
235 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  34.33 
 
 
232 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  34.33 
 
 
232 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  34.33 
 
 
232 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  34.33 
 
 
232 aa  148  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  35.47 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  38.46 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  38.46 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  33.91 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  38.46 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  33.91 
 
 
232 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  32.19 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  37.61 
 
 
236 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  35.04 
 
 
232 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  33.48 
 
 
232 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  34.62 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2313  pirin domain-containing protein  42.27 
 
 
232 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  36.75 
 
 
236 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  35.44 
 
 
235 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  34.19 
 
 
232 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2448  pirin domain-containing protein  41.75 
 
 
233 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  37.61 
 
 
241 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  34.62 
 
 
233 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  33.05 
 
 
232 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  33.48 
 
 
232 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  35.9 
 
 
229 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  37.87 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  35.9 
 
 
232 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  33.33 
 
 
232 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  33.76 
 
 
232 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  40.74 
 
 
232 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  34.89 
 
 
233 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  35.9 
 
 
241 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  34.19 
 
 
233 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
235 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  35.47 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  35.9 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  40 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  36.48 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09076  possible Pirin family protein  30.6 
 
 
238 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
241 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  35.04 
 
 
241 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  34.62 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  35.04 
 
 
239 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  33.76 
 
 
241 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  34.03 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  35.34 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  35.78 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  32.48 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  39.52 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2407  pirin domain-containing protein  39.39 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.0125724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1791  Pirin-like  39.39 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2403  pirin domain-containing protein  39.39 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  30.77 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  30.77 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27889  predicted protein  34.01 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.731837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  33.76 
 
 
232 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  31.65 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  31.65 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  33.94 
 
 
240 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  33.76 
 
 
233 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  32.91 
 
 
233 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>