55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4077 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  76.27 
 
 		 277 aa  298  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  74.72 
 
 		 281 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 279 aa  214  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  47.49 
 
 		 279 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 277 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 279 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 279 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 279 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  37.04 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 271 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 300 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 300 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 300 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2178  transcription activator, effector binding  26.56 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01850  probable transcriptional regulator  23.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 281 aa  52.4  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  30.1 
 
 		 110 aa  51.2  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 280 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  31.73 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  25.31 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 277 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  31.4 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 298 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2293  transcription activator effector binding protein  23.85 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2325  hypothetical protein  26.06 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0797882  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  39.22 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  27.5 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 288 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  21.09 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  22.15 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 		 314 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  24.34 
 
 		 302 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  34.33 
 
 		 286 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  32.84 
 
 		 326 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  20.75 
 
 		 290 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  31.94 
 
 		 159 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 293 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  29 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  27.74 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  27.78 
 
 		 265 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>