More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0315 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
346 aa  688    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.618747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1073  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  58.55 
 
 
346 aa  427  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.47 
 
 
349 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
349 aa  362  5.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
348 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0719  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.45 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
356 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
358 aa  175  9e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.606481  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
356 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0953603  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
344 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.04 
 
 
372 aa  159  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.433109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
339 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
326 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
325 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
326 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
370 aa  152  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0478447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.32 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 
321 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
320 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  30 
 
 
324 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
343 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.58 
 
 
326 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
321 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
328 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 
320 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
318 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
318 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  33.33 
 
 
318 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
318 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
318 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  33.33 
 
 
307 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
307 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.798458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
339 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  32.62 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
318 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1749  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.71 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.258906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  35.17 
 
 
321 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
316 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
307 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
328 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  31.31 
 
 
316 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  29.19 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
316 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  29.55 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 
336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
372 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.231661  normal  0.721706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 
316 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
327 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
321 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
334 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
322 aa  132  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238126  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.93 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
478 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7053  oligopeptide ABC transporter membrane protein  31.11 
 
 
370 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  31.77 
 
 
316 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.77 
 
 
316 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.67 
 
 
326 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
328 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
338 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  29.33 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.48 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
327 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
331 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
369 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.02836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>