More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0125 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
340 aa  679    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
355 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.445953  normal  0.241601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
345 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76093  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
317 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  28.25 
 
 
326 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
317 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2948  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
318 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
514 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
336 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.94 
 
 
307 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.71 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.23 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.85 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.89 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  23.82 
 
 
410 aa  96.7  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.1 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.88 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
317 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.04 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.91 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.41 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.42 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  26.77 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.39 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
312 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
331 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  26.38 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.56 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  26.38 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.74 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.04 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
330 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02955  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.95 
 
 
339 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
346 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.21 
 
 
316 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
313 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
307 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.67 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.18 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.13 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  27.13 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.13 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258351  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.13 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.3 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1416  nucleotide sugar dehydratase, putative  25.98 
 
 
352 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.439402  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.78 
 
 
307 aa  87  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
319 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.29 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.5 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
309 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
315 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
316 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 
313 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.96 
 
 
326 aa  86.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>