41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2718 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  447  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  64.39 
 
 
211 aa  277  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  61.27 
 
 
217 aa  262  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  60.29 
 
 
217 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  46.89 
 
 
217 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  47.12 
 
 
216 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  46.63 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  45.77 
 
 
213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  47.64 
 
 
218 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  45.97 
 
 
218 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  44.5 
 
 
217 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  44.02 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  47.89 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
215 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  39.61 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  45.85 
 
 
219 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  43.78 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  40.85 
 
 
241 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  43.17 
 
 
225 aa  158  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  45.56 
 
 
215 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  45.78 
 
 
402 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  41.09 
 
 
216 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  38.42 
 
 
229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  39.11 
 
 
216 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  41.15 
 
 
412 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  43.09 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  40.59 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  35.82 
 
 
212 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  41.09 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  39.88 
 
 
403 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  38.46 
 
 
212 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  37.28 
 
 
212 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  42.25 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  35.23 
 
 
350 aa  134  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  43.2 
 
 
315 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
399 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  22.81 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
312 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  25.74 
 
 
218 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>