More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1927 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
378 aa  759    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  71.06 
 
 
389 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  57.18 
 
 
360 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  57.26 
 
 
380 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  58.09 
 
 
375 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  58.09 
 
 
375 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  56.33 
 
 
504 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  60.37 
 
 
376 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  58.14 
 
 
367 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  53.95 
 
 
498 aa  362  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  55.03 
 
 
355 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  53.67 
 
 
498 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  54.37 
 
 
441 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  52.8 
 
 
446 aa  358  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  55.93 
 
 
366 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  56.43 
 
 
413 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  56.72 
 
 
603 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  56.84 
 
 
331 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  53.26 
 
 
357 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  53.78 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  56.84 
 
 
358 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  55.62 
 
 
325 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  52.19 
 
 
520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  55.69 
 
 
509 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  54.38 
 
 
433 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  46.48 
 
 
375 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  50.76 
 
 
399 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  43.1 
 
 
374 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  43.37 
 
 
373 aa  258  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  41.46 
 
 
370 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  45.29 
 
 
364 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  42.98 
 
 
378 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  40.75 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  42.69 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  42.69 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  43.52 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  45.19 
 
 
435 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  45.96 
 
 
355 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  45.88 
 
 
363 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  45.21 
 
 
377 aa  242  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  29.48 
 
 
308 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  33.53 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.88 
 
 
549 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.24 
 
 
303 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 
311 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  26.97 
 
 
305 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  33.74 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  30.24 
 
 
319 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  34.7 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  31.4 
 
 
510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  32.82 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.4 
 
 
511 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  30.96 
 
 
321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  30.06 
 
 
513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  30.75 
 
 
318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 
301 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.48 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
311 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  31.79 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  34.59 
 
 
319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  27.89 
 
 
545 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  27.89 
 
 
545 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.41 
 
 
305 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.09 
 
 
550 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  31.93 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.36 
 
 
557 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
570 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  31.6 
 
 
311 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  34.24 
 
 
307 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  31.52 
 
 
353 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  32.73 
 
 
308 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 
331 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  29.57 
 
 
501 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  31.85 
 
 
328 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  32.33 
 
 
307 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
338 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
318 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  28.4 
 
 
520 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  24 
 
 
300 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  30.12 
 
 
505 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  29.55 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
550 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.38 
 
 
544 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.38 
 
 
544 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  28 
 
 
501 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  32.42 
 
 
315 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  29.57 
 
 
545 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  31.64 
 
 
312 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  30.64 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.05 
 
 
505 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  27.33 
 
 
519 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.99 
 
 
519 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  29.04 
 
 
523 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  27.73 
 
 
500 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  28.18 
 
 
501 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>