40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1025 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  344  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  41.88 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  37.27 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  37.27 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  42.07 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  34.57 
 
 		 255 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  34.76 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  36.24 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  38.51 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  35.8 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  38.24 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  31.18 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  32.91 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  33.11 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  29.73 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  27.7 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  31.46 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  32.64 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  35.04 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.14 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  27.46 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  26.14 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  32.48 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  31.08 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  30.34 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  31.08 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.63 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  27.98 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  23.31 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  23.31 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  29.23 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  29.13 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  32.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  29.41 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  30.83 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>