33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  295  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  50.34 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  52.41 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  49.33 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  45.83 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  37.39 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  39 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  44.9 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  40.82 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  42.55 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  45.74 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  39.39 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  35.58 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  35.71 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  38.78 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  37.17 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  48.89 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  36.7 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  41.41 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  36.14 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  31.13 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  34.21 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  31.46 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  31.46 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  31.46 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  31.82 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  32.22 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  25.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  29.81 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>