More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7257 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7257  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  100 
 
 
477 aa  982    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7134  threonyl-tRNA synthetase  71.39 
 
 
404 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5039  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  59.85 
 
 
402 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115182  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
640 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
640 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
636 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
644 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
638 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
644 aa  438  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
641 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
640 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
640 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
640 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
641 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
654 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
652 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2149  threonyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
641 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320592  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
640 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
640 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  50.37 
 
 
638 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
646 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
643 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
638 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
640 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
644 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1090  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
585 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
635 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
640 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
640 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
646 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
646 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
635 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
648 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
640 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2805  threonyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
633 aa  425  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
640 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
640 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
645 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
640 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
642 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
659 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
640 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
640 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
635 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
633 aa  418  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
638 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
635 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01383  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
649 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2180  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
642 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0516058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20420  threonyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
640 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
642 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06231  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
638 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
633 aa  415  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06531  threonyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
638 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.218915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
648 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
635 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1951  threonyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
642 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
638 aa  415  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
660 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
633 aa  413  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
642 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
660 aa  415  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0597  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
638 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
635 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2053  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
642 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.22159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1888  threonyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
642 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
642 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
635 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
642 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
635 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2099  threonyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 
635 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
635 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
642 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
642 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
637 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
637 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
635 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
642 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2625  threonyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
642 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000821618  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1820  threonyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
642 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2020  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
635 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
669 aa  412  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
642 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
635 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
638 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1712  threonyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
642 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1472  threonyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
642 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000205456  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06621  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
638 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
637 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>