85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6058 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  100 
 
 
344 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  95.35 
 
 
343 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  95.06 
 
 
343 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  95.35 
 
 
343 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  95.35 
 
 
344 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  95.06 
 
 
344 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  88.37 
 
 
340 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  73.35 
 
 
340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  76.06 
 
 
324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  75.45 
 
 
323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  75.45 
 
 
323 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  75.45 
 
 
323 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  75.45 
 
 
323 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  75.45 
 
 
323 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  75.45 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  61.38 
 
 
331 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  62.06 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  59.47 
 
 
330 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.59 
 
 
339 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  53.16 
 
 
327 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  51.66 
 
 
329 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.59 
 
 
339 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  49.44 
 
 
356 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  41.94 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.69 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  42.46 
 
 
288 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.46 
 
 
295 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.94 
 
 
303 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.68 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.19 
 
 
303 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.2 
 
 
333 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  40.19 
 
 
273 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  39.26 
 
 
311 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.99 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.18 
 
 
330 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.1 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.48 
 
 
343 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.52 
 
 
337 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  34.89 
 
 
270 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.69 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  34.58 
 
 
270 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.66 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.66 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.88 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.89 
 
 
292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.04 
 
 
295 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  29.56 
 
 
280 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.57 
 
 
308 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.78 
 
 
291 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.05 
 
 
287 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.44 
 
 
287 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.88 
 
 
272 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.64 
 
 
308 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.75 
 
 
281 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  29.45 
 
 
284 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.44 
 
 
287 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.75 
 
 
287 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  32.61 
 
 
295 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  30.97 
 
 
204 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  29.91 
 
 
301 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.35 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.84 
 
 
311 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  31.11 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  28 
 
 
291 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  29.32 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  26.77 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  27.38 
 
 
316 aa  89.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  29.9 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.61 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.75 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.06 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  26.54 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.11 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  23.97 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.92 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4395  hypothetical protein  35.85 
 
 
146 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.262018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  27.4 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  24.22 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.9 
 
 
337 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.53 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.62 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.89 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.67 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.93 
 
 
318 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>