More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4915 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4915  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5420  transcriptional regulator, LysR family  52 
 
 		 307 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5983  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4348  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4613  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 296 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2230  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0297  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2809  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  38.91 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0278  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277872  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1781  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  38.46 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2842  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0986  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1067  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1018  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1052  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0958  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2074  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33440  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0395632  normal  0.113428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.03 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0965  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292002  normal  0.0128926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2189  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 301 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 335 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5723  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3786  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4582  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00622026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1151  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0672  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1029  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>