More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6827 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  78.39 
 
 		 209 aa  331  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  77.55 
 
 		 212 aa  328  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  77.94 
 
 		 292 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  77.94 
 
 		 292 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  77.94 
 
 		 292 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  77.94 
 
 		 292 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  77.94 
 
 		 292 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  76.88 
 
 		 212 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  78.71 
 
 		 236 aa  327  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  78.71 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  77.39 
 
 		 209 aa  324  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  77.66 
 
 		 209 aa  324  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  76.88 
 
 		 209 aa  323  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  76.88 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  78.57 
 
 		 258 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  77.16 
 
 		 211 aa  321  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  77.16 
 
 		 211 aa  321  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  76.65 
 
 		 211 aa  320  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  73.13 
 
 		 206 aa  320  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  69.07 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  67.69 
 
 		 234 aa  288  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  67.2 
 
 		 205 aa  277  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 		 203 aa  254  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  63.78 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  60.11 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  59.69 
 
 		 203 aa  251  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  59.16 
 
 		 203 aa  247  8e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  60.66 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  60.44 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  60.11 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  54.73 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  58.92 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  59.46 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  58.24 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  57.98 
 
 		 222 aa  235  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 		 213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52.74 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  59.89 
 
 		 192 aa  232  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  55.91 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  55.91 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  54.79 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  55.84 
 
 		 241 aa  225  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  57.46 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  54.3 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 		 269 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 		 269 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 		 206 aa  224  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  55.9 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 		 200 aa  224  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  53.62 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  53.77 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 229 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  49.01 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 235 aa  209  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  48.28 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  48.29 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  55.98 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 189 aa  198  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  52.94 
 
 		 198 aa  198  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 		 201 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  48.91 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  51.52 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  53.65 
 
 		 200 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  54.26 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  49.24 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  49.24 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  47.52 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 190 aa  194  9e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  54.59 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  47.76 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  53.03 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>