More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4901 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  78.57 
 
 		 448 aa  747    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  91.74 
 
 		 448 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  90.85 
 
 		 448 aa  819    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 448 aa  922    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  82.31 
 
 		 451 aa  768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  97.54 
 
 		 448 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  78.79 
 
 		 448 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  74.83 
 
 		 448 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 448 aa  922    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  79.02 
 
 		 448 aa  748    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  91.96 
 
 		 448 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 448 aa  922    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  57.24 
 
 		 454 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  36.03 
 
 		 460 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  36.03 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  36.03 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  35.81 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  35.12 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  34.9 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  37.92 
 
 		 472 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  35.12 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  34.9 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  39.09 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  36.22 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  34.9 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  34.9 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  34.68 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  34.45 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  34.45 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  34.45 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  34.23 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  34.38 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 458 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  36.78 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  36.78 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  36.78 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  37.47 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  36.78 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  36.78 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  36.78 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  36.78 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  36.78 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  34 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  36.34 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  37.9 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  34.59 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  37.88 
 
 		 459 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  34 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  34.53 
 
 		 465 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  36.14 
 
 		 466 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  33.84 
 
 		 463 aa  236  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  34.81 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  34.49 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  34 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  32.89 
 
 		 455 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  33.94 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  34.7 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  32.65 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  33.71 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  33.79 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  34.16 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  34.16 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  33.26 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  35.82 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  34.25 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 454 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  33.04 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  33.71 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  33.92 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  33.56 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  33.56 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  33.11 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  32.59 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  33.92 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  31.97 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2188  glutamate--putrescine ligase  34.75 
 
 		 447 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000050762  unclonable  0.00000655518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  33.11 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  33.11 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  35.23 
 
 		 458 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0800  glutamine synthetase  32.01 
 
 		 478 aa  206  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2138  glutamate--putrescine ligase  34.53 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000330057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 		 449 aa  206  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2246  Glutamate--putrescine ligase  34.75 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000577408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  32.67 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4519  hypothetical protein  34.53 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  34 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  34 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  33.78 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  34 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2233  glutamate--ammonia ligase  34.53 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  31.53 
 
 		 476 aa  204  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  33.03 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  33.33 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  33.03 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  33.48 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  33.26 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>