83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3091 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3091  Methyltransferase type 11  100 
 
 
227 aa  428  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.974838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  49.21 
 
 
223 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8283  hypothetical protein  43.4 
 
 
213 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1721  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
237 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0981  hypothetical protein  49.72 
 
 
241 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316182  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  44.26 
 
 
209 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  44.26 
 
 
209 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  44.26 
 
 
209 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  50.76 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  43.72 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
293 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
232 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  29 
 
 
541 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29 
 
 
541 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29 
 
 
541 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.42 
 
 
217 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29 
 
 
541 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29 
 
 
541 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4270  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
299 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0859626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  31.78 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
265 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  50 
 
 
208 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.48 
 
 
266 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  51.22 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  40 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.93 
 
 
200 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  47.17 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  48.84 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  47.37 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.39 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.2 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  22.52 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  21.76 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25.22 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  23.31 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  52.27 
 
 
400 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.65 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.39 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  46.51 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  31.9 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  48.84 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  47.73 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.19 
 
 
254 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  44.19 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.29 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
273 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  24.5 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.29 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
205 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.58 
 
 
235 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
232 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 
232 aa  42  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.12 
 
 
230 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 
233 aa  42  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  20.71 
 
 
239 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  26.42 
 
 
267 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.43 
 
 
391 aa  42  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.85 
 
 
247 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.16 
 
 
336 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.37 
 
 
250 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  32.46 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>