41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1149 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  873    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.65 
 
 		 231 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  35.57 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.46 
 
 		 218 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  46.15 
 
 		 218 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  40.91 
 
 		 225 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  38.07 
 
 		 223 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  40.85 
 
 		 236 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.31 
 
 		 219 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  39.72 
 
 		 215 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  34.86 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.69 
 
 		 235 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  39.88 
 
 		 236 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  40 
 
 		 217 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.23 
 
 		 224 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  29.11 
 
 		 232 aa  72  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.24 
 
 		 256 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  46.39 
 
 		 99 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.44 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  29.63 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.16 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  32 
 
 		 128 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 		 121 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 		 136 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  40.3 
 
 		 127 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  30.97 
 
 		 116 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  29.73 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  30.56 
 
 		 116 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  26.81 
 
 		 141 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  32.8 
 
 		 123 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3635  hypothetical protein  34.83 
 
 		 157 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276283  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3562  hypothetical protein  34.83 
 
 		 157 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00833026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3567  hypothetical protein  35.96 
 
 		 210 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  30.26 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  27.46 
 
 		 144 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>