35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0994 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.94 
 
 
312 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.64 
 
 
242 aa  198  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 
258 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  41.81 
 
 
386 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.39 
 
 
319 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  40 
 
 
537 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.27 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  32.08 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.73 
 
 
316 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.34 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.52 
 
 
507 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  31.5 
 
 
323 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.05 
 
 
655 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.53 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.25 
 
 
650 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.54 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
243 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  29.2 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.33 
 
 
291 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 
216 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  30.48 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  33.66 
 
 
525 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.67 
 
 
499 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.79 
 
 
530 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  45.59 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  36.17 
 
 
402 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.46 
 
 
372 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
315 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.28 
 
 
202 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>