48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6231 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6231  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 167 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6223  phosphopantetheine-binding  45.95 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  37.74 
 
 		 897 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  28.32 
 
 		 3679 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30000  polyketide synthase  32.89 
 
 		 18193 aa  47.8  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119561  polyketide synthase  29.27 
 
 		 4526 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  38.6 
 
 		 3355 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6560  acyl carrier protein  30.95 
 
 		 89 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  41.94 
 
 		 2126 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 1208 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29828  predicted protein  33.33 
 
 		 4962 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5780  phosphopantetheine-binding  32.18 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  37.93 
 
 		 3670 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 		 3676 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 		 1831 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 		 3702 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 		 3693 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 		 3693 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 		 5255 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  35.09 
 
 		 4111 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  30.1 
 
 		 4264 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  36.49 
 
 		 79 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 2376 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  37.14 
 
 		 79 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  27.12 
 
 		 3148 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 		 1474 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 79 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0750  phosphopantetheine-binding  35.71 
 
 		 93 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0676066  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 79 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 79 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 79 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 79 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  33.72 
 
 		 3033 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 		 5154 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  24.24 
 
 		 4151 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0773  phosphopantetheine-binding  35.71 
 
 		 93 aa  41.2  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  35.48 
 
 		 1616 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11681  polyketide synthase pks17  35.09 
 
 		 502 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000530022  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18390  phosphopantetheine-containing protein  27.4 
 
 		 88 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.674444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  27.71 
 
 		 2134 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 79 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 4930 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  39.29 
 
 		 1537 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  37.14 
 
 		 79 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  37.14 
 
 		 79 aa  40.8  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  27.59 
 
 		 3696 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 		 1656 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>