34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4084 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  98.61 
 
 		 144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  86.11 
 
 		 144 aa  253  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  82.64 
 
 		 144 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  81.94 
 
 		 144 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  81.25 
 
 		 144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  81.25 
 
 		 144 aa  227  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  71.53 
 
 		 177 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  70.14 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  70.14 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  70.14 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  70.14 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  70.14 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  70.14 
 
 		 144 aa  205  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  70.14 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  45.83 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  47.22 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  40.28 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  40.28 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  35.92 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  32.64 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.61 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.03 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.51 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.28 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  30.41 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  35.14 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  29.37 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>