More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2601 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  97.73 
 
 		 309 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  98.71 
 
 		 309 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  99.03 
 
 		 309 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  99.68 
 
 		 309 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 560 aa  1157    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  97.73 
 
 		 309 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  99.03 
 
 		 309 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  94.5 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  94.5 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  94.5 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  94.5 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  93.85 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  94.5 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  94.5 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  94.5 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  89.97 
 
 		 309 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  88.35 
 
 		 309 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  88.03 
 
 		 309 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  76.82 
 
 		 308 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  77.41 
 
 		 308 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  76.49 
 
 		 308 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  74.5 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 307 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  73.84 
 
 		 326 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  73.86 
 
 		 307 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  72.28 
 
 		 306 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  70.92 
 
 		 329 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  70.92 
 
 		 311 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  70.39 
 
 		 308 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 		 302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  69.54 
 
 		 309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 		 309 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  70.87 
 
 		 310 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  70.16 
 
 		 305 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  70.3 
 
 		 305 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  70.16 
 
 		 305 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  67.31 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  67.63 
 
 		 320 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  67.99 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  68.2 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  64.8 
 
 		 329 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  58.67 
 
 		 300 aa  369  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 		 300 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 		 298 aa  356  5e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  58.92 
 
 		 301 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 		 303 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  56.48 
 
 		 304 aa  352  7e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 		 312 aa  352  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 311 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 311 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 		 321 aa  349  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  58.72 
 
 		 304 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 		 306 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  55.18 
 
 		 306 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 305 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 		 304 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 305 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 305 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 307 aa  332  9e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 		 305 aa  332  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 305 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  54.21 
 
 		 307 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 		 306 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 306 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 		 306 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 305 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 		 308 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 303 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 306 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  53.54 
 
 		 306 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  53.2 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 303 aa  323  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 		 312 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 303 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 303 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 303 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.61 
 
 		 309 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 315 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 307 aa  302  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 355 aa  299  9e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 		 308 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 		 302 aa  297  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 316 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 308 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 308 aa  293  5e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 328 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 		 309 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 308 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  290  6e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 		 309 aa  289  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 		 304 aa  288  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 308 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 303 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 		 305 aa  288  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 		 312 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 		 313 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 310 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>