39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6746 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  58.16 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  31.55 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  27.45 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  26.81 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  26.03 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  26.03 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  26.03 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  22.32 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  27.4 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  27.43 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  26.22 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  34.32 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  26.32 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  28.68 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  37.74 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  28.65 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  30.83 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  29.27 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  25.77 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  29.27 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  26.96 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.08 
 
 		 175 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  31.53 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  29.65 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  36.84 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  31.93 
 
 		 174 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  22.73 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  23.31 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  26.53 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  30.47 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.38 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  31.78 
 
 		 390 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  38.95 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  25.16 
 
 		 170 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  44.07 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  44.07 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  44.07 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  31.18 
 
 		 366 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>