More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3360 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  98.2 
 
 		 332 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  81.93 
 
 		 334 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.84 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.84 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.84 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.84 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.84 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  34.19 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  27.1 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  28.06 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  27.85 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  27.64 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  27.64 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  27.64 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  27.64 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  27.64 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  28.7 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  30.79 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  30.37 
 
 		 312 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  26.71 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  26.4 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  26.4 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  26.4 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  26.4 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  26.4 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  26.09 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  28.39 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  23.79 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2611  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>