102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3651 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3651  DNA methylase  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.061929  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  86.67 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3667  DNA methylase  98.55 
 
 		 138 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  62.66 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  61.39 
 
 		 249 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  47.51 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.85 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  43.98 
 
 		 243 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  43.98 
 
 		 243 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  38.46 
 
 		 265 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.58 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.22 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.02 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  41.82 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.36 
 
 		 265 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.82 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  33 
 
 		 247 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.42 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.24 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.05 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.81 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.07 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.81 
 
 		 377 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  30.98 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  30.98 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  29.07 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1911  putative DNA-methyltransferase protein  46.97 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.41 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  27.01 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  28.57 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  29.73 
 
 		 377 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  26.86 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  26.04 
 
 		 379 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  26.29 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  26.86 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.41 
 
 		 369 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  25.81 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.81 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  26.29 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.81 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.78 
 
 		 368 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  22.78 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  25.81 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.81 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.98 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.43 
 
 		 389 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.81 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.13 
 
 		 379 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.41 
 
 		 369 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.35 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.32 
 
 		 419 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.8 
 
 		 380 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.6 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.9 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  24.31 
 
 		 389 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.63 
 
 		 301 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.72 
 
 		 379 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  24.86 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  27.59 
 
 		 372 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.75 
 
 		 370 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  24.57 
 
 		 377 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  26.8 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  24.86 
 
 		 368 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  23.76 
 
 		 380 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.13 
 
 		 305 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.78 
 
 		 370 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  24 
 
 		 376 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  25.38 
 
 		 311 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.26 
 
 		 398 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.09 
 
 		 398 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.58 
 
 		 373 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.19 
 
 		 396 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.23 
 
 		 398 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  23.43 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  22.92 
 
 		 367 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  26.28 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.7 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  26.49 
 
 		 378 aa  46.2  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  26.04 
 
 		 304 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.15 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  24.18 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.49 
 
 		 483 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  38.03 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  24.65 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.19 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  22.86 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.4 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.27 
 
 		 370 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.65 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  23.43 
 
 		 377 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.65 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.65 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  24.65 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  24.65 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  24.65 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.78 
 
 		 382 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  22.86 
 
 		 377 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.67 
 
 		 273 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.85 
 
 		 305 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0719  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.47 
 
 		 368 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>