17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3692 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  79.05 
 
 		 596 aa  847    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  100 
 
 		 589 aa  1166    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  36.9 
 
 		 783 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  31.89 
 
 		 956 aa  77  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  32.94 
 
 		 743 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  32.77 
 
 		 1426 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  27.84 
 
 		 772 aa  57.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  28.99 
 
 		 282 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  31.61 
 
 		 296 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  38.78 
 
 		 724 aa  47.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  30.19 
 
 		 601 aa  47  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  37.68 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  55.26 
 
 		 757 aa  45.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1421  hypothetical protein  38.71 
 
 		 575 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000284545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  33.03 
 
 		 508 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  23.34 
 
 		 311 aa  43.9  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>