More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1018 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1171  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2942  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
259 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1018  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1657  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
278 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1011  uroporphyrin-III C-methyltransferase  99.22 
 
 
259 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0819  uroporphyrin-III C-methyltransferase  92.22 
 
 
257 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5801  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.25 
 
 
249 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0785741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.25 
 
 
249 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2470  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.25 
 
 
249 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2475  uroporphyrin-III C-methyltransferase  89.83 
 
 
249 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2387  uroporphyrin-III C-methyltransferase  89.79 
 
 
249 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  89.36 
 
 
249 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2230  uroporphyrin-III C-methyltransferase  87.66 
 
 
255 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0824  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.21 
 
 
252 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350857  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0975  uroporphyrin-III C-methyltransferase  86.02 
 
 
251 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3659  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.9 
 
 
251 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2811  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65 
 
 
254 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481066  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.98 
 
 
273 aa  291  8e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2684  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.78 
 
 
269 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2691  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
267 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2224  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.39 
 
 
269 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2420  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.98 
 
 
269 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0998  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.73 
 
 
267 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.83 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.03 
 
 
478 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
478 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
528 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
481 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  45.8 
 
 
464 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
464 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.78 
 
 
271 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
273 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
272 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 
464 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.64 
 
 
463 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.64 
 
 
463 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
484 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
464 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.88 
 
 
554 aa  175  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.78 
 
 
240 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  44.54 
 
 
464 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
475 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
463 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  46.61 
 
 
478 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  46.61 
 
 
477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
487 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.35 
 
 
462 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
277 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.68 
 
 
503 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.81 
 
 
479 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1555  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.63 
 
 
545 aa  171  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.93 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
276 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.38 
 
 
273 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
278 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  45.34 
 
 
485 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
507 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
277 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
503 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.46 
 
 
480 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
281 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
281 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
278 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.35 
 
 
503 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
276 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.28 
 
 
473 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.83 
 
 
269 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  42.5 
 
 
513 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
258 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.35 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  42.02 
 
 
465 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1710  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0206  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  38.71 
 
 
474 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.17 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.26 
 
 
250 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.73 
 
 
273 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
253 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
258 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  43.2 
 
 
520 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.15 
 
 
258 aa  165  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  42.02 
 
 
465 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
317 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.848441  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.5 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.62 
 
 
271 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  44.44 
 
 
472 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.49 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190604  normal  0.797917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.72 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  44.44 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.31 
 
 
272 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.79 
 
 
253 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
258 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.64 
 
 
269 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>