229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0544 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
614 aa  1248    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  59.61 
 
 
622 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  71.67 
 
 
635 aa  879    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  58.93 
 
 
622 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  73.49 
 
 
616 aa  929    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  72.01 
 
 
618 aa  926    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  50.68 
 
 
627 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  50.76 
 
 
627 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  51.49 
 
 
880 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  50.99 
 
 
627 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  52.17 
 
 
886 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.84 
 
 
617 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.6 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  26.7 
 
 
888 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.37 
 
 
980 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
1231 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.48 
 
 
544 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
591 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
1140 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.36 
 
 
822 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  26.33 
 
 
909 aa  85.5  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
620 aa  84.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  23.75 
 
 
712 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.51 
 
 
831 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  28.2 
 
 
788 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  23.47 
 
 
737 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  28.2 
 
 
788 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  24.82 
 
 
855 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
1140 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  25.35 
 
 
624 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.22 
 
 
834 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.21 
 
 
716 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.97 
 
 
730 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
1140 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.73 
 
 
741 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.44 
 
 
810 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.79 
 
 
794 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
1129 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  26.3 
 
 
778 aa  77  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.22 
 
 
930 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 
547 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.04 
 
 
586 aa  75.5  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
772 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 
650 aa  75.1  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.27 
 
 
851 aa  74.3  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  27.82 
 
 
729 aa  74.3  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.12 
 
 
730 aa  74.3  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  26.14 
 
 
788 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  24.75 
 
 
749 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  24.83 
 
 
872 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.53 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  24.64 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  24.81 
 
 
707 aa  71.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27 
 
 
811 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2615  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.27 
 
 
641 aa  71.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.23 
 
 
702 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  23.2 
 
 
672 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  24.15 
 
 
872 aa  69.3  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.53 
 
 
672 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  25.62 
 
 
845 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  25.44 
 
 
699 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  24.5 
 
 
726 aa  68.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  23.37 
 
 
665 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.59 
 
 
845 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.44 
 
 
846 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.94 
 
 
804 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  24.85 
 
 
845 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.33 
 
 
773 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  24.33 
 
 
773 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  23.79 
 
 
872 aa  67.4  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
917 aa  67.4  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  26.14 
 
 
899 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  26.56 
 
 
867 aa  67.4  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  23.93 
 
 
872 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.93 
 
 
872 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
848 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
846 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  23.93 
 
 
872 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.04 
 
 
845 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  23.93 
 
 
872 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  25.19 
 
 
666 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.11 
 
 
656 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
848 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  25 
 
 
846 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
848 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.11 
 
 
672 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  23.93 
 
 
872 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
857 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  23.93 
 
 
872 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  23.93 
 
 
872 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  27.11 
 
 
848 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24 
 
 
1135 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  23.24 
 
 
501 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.53 
 
 
696 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  22.48 
 
 
661 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.37 
 
 
520 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  23.8 
 
 
905 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  27.74 
 
 
758 aa  65.1  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>