More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1632 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1632  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase component  100 
 
 
540 aa  1101    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  76.59 
 
 
548 aa  852    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  54.33 
 
 
527 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  53.61 
 
 
537 aa  555  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  51.12 
 
 
530 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  51.3 
 
 
540 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  53.76 
 
 
532 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  53.59 
 
 
526 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  53.94 
 
 
527 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  51.67 
 
 
534 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  51.93 
 
 
543 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.58 
 
 
529 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  54.23 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  53.48 
 
 
531 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  52.29 
 
 
524 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  52.36 
 
 
529 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  50.65 
 
 
546 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  54.64 
 
 
534 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  53.49 
 
 
529 aa  531  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  50.76 
 
 
527 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  51.7 
 
 
536 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  51.38 
 
 
530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  51.76 
 
 
536 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  49.72 
 
 
531 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  49.09 
 
 
551 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  50.9 
 
 
527 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  51.25 
 
 
541 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  51.11 
 
 
515 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  50.91 
 
 
515 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  50 
 
 
550 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  50.1 
 
 
527 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  47.44 
 
 
549 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  49.06 
 
 
552 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  49.7 
 
 
512 aa  501  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  50.1 
 
 
531 aa  499  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  50 
 
 
522 aa  500  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  47.28 
 
 
556 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  50.41 
 
 
514 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  50.6 
 
 
512 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  47.28 
 
 
556 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  47.28 
 
 
556 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  46.88 
 
 
542 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  48.64 
 
 
542 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  49.9 
 
 
531 aa  495  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  48.53 
 
 
538 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  47.51 
 
 
548 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  48.53 
 
 
514 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  47.54 
 
 
538 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  48.08 
 
 
516 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  50.3 
 
 
518 aa  488  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  48.71 
 
 
516 aa  487  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  49.49 
 
 
510 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  48.92 
 
 
513 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  48.29 
 
 
516 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  49.19 
 
 
516 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  47.53 
 
 
516 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  48.18 
 
 
516 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  49.6 
 
 
519 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  49.8 
 
 
519 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  46.63 
 
 
528 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  49.8 
 
 
519 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  48.21 
 
 
559 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  48.89 
 
 
516 aa  477  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  48.31 
 
 
519 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  46.39 
 
 
514 aa  478  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  48.69 
 
 
516 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  49 
 
 
516 aa  477  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  47.11 
 
 
516 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  47.28 
 
 
522 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  49.51 
 
 
510 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  46.81 
 
 
514 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  47.47 
 
 
510 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  47.76 
 
 
522 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  45.67 
 
 
518 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  48.33 
 
 
520 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  47.5 
 
 
510 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  48.01 
 
 
508 aa  473  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  46.77 
 
 
516 aa  473  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  47.28 
 
 
510 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  48.08 
 
 
516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  48.22 
 
 
510 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  47.17 
 
 
517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  47.76 
 
 
524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  48.19 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  46.55 
 
 
520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  45.84 
 
 
508 aa  467  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  48.19 
 
 
510 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  48.28 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  47.07 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  46.75 
 
 
515 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  48.72 
 
 
518 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  47.88 
 
 
521 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  47.99 
 
 
514 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  47.51 
 
 
510 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  47.71 
 
 
510 aa  465  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  47.5 
 
 
513 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  48.28 
 
 
510 aa  465  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  47.28 
 
 
510 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  47.51 
 
 
510 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  47.55 
 
 
519 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>