39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0829 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  100 
 
 		 188 aa  400  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  54.91 
 
 		 601 aa  211  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  52.91 
 
 		 644 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  52.54 
 
 		 598 aa  190  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  50.29 
 
 		 603 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  49.71 
 
 		 603 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  49.71 
 
 		 603 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  49.14 
 
 		 603 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  49.14 
 
 		 603 aa  175  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  49.14 
 
 		 603 aa  175  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  49.14 
 
 		 603 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  49.14 
 
 		 603 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  49.14 
 
 		 603 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  49.71 
 
 		 598 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  49.13 
 
 		 588 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  45.88 
 
 		 599 aa  170  9e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  46.93 
 
 		 590 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  44.64 
 
 		 596 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  45.14 
 
 		 512 aa  153  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  42.77 
 
 		 577 aa  137  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  34.12 
 
 		 564 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  34.12 
 
 		 563 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  34.48 
 
 		 558 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 		 598 aa  68.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  29.51 
 
 		 604 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.75 
 
 		 603 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  26.76 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  28.87 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.74 
 
 		 862 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  27.59 
 
 		 591 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.06 
 
 		 625 aa  58.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  32.02 
 
 		 707 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  29.55 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  29.02 
 
 		 897 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.16 
 
 		 587 aa  55.1  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  29.71 
 
 		 704 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.47 
 
 		 894 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.19 
 
 		 607 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  23.91 
 
 		 677 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>