177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6907 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  66.19 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4270  hypothetical protein  64.71 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.372249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4168  hypothetical protein  61.76 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1291  hypothetical protein  62.5 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2582  hypothetical protein  45.59 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2902  hypothetical protein  45.59 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2661  hypothetical protein  44.85 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2855  hypothetical protein  44.85 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.266671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2860  hypothetical protein  44.85 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00728659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2885  hypothetical protein  44.85 
 
 		 143 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  32.81 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  34.65 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  31.65 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  32.71 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  29.55 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  32.12 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  34.85 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  29.77 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  32.33 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  31.06 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  34.86 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  28.03 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  33.1 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4191  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  31.93 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  31.65 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  31.3 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  29.27 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  32.82 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  30.66 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  27.91 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  32.58 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  30.08 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  31.48 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  32.73 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  31.21 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  36.45 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  27.69 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  31.54 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  34.23 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  31.75 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  31.3 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  29.09 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  26.36 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  31.82 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  33.58 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  34.91 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2140  cytidine deaminase  27.54 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.621603  normal  0.187784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  34.68 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.04 
 
 		 582 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  34.26 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  27.21 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  31.53 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  26.52 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  30.3 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  30.09 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  30.88 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  30.53 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  32.84 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  31.54 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  32.48 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  26.15 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  32.41 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  32.41 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  33.08 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  31.19 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0498  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.115067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  29.01 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  30.56 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0733  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00269425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  31.34 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  27.13 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  31.06 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  29.55 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  29.91 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  29.75 
 
 		 388 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  29.63 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>