24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5172 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  50.88 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  62.4 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  29.07 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  27.32 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  28.92 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  30.61 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 3145 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 425 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 898 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  32.09 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25.37 
 
 		 560 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 643 aa  41.2  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  26.98 
 
 		 604 aa  41.2  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  24.1 
 
 		 580 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>