64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3408 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  54.29 
 
 		 283 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  49.3 
 
 		 283 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  52.63 
 
 		 284 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 		 284 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  54.93 
 
 		 281 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.17 
 
 		 639 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  55.71 
 
 		 296 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  52.78 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  56.72 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  51.43 
 
 		 284 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  52.17 
 
 		 289 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  50.7 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  50.7 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  50.72 
 
 		 290 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  50.7 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  47.89 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  49.3 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  47.83 
 
 		 303 aa  74.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 321 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 		 324 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  44.59 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  46.38 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  54.55 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  51.52 
 
 		 321 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  47.83 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  49.28 
 
 		 329 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  47.76 
 
 		 311 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  44.29 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  46.38 
 
 		 315 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  44.93 
 
 		 323 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  43.08 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  41.89 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 309 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  43.24 
 
 		 300 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  41.33 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  45.71 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  45.71 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  40.58 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  45.71 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.25 
 
 		 290 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 335 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  36.84 
 
 		 313 aa  57.4  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  40.85 
 
 		 289 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 		 287 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 		 293 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 		 301 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 308 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 297 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 		 275 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  44.74 
 
 		 348 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>