More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2604 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1003    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  57.14 
 
 		 491 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  50.22 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  52.7 
 
 		 611 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  50.66 
 
 		 654 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  50.22 
 
 		 657 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  47.52 
 
 		 698 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  47.16 
 
 		 616 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  48.46 
 
 		 570 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  46.7 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  43.97 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  41.07 
 
 		 292 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  40 
 
 		 1911 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  33.23 
 
 		 346 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  41.7 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  40.34 
 
 		 620 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  41.18 
 
 		 291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  40.08 
 
 		 522 aa  163  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  38.14 
 
 		 269 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  39.45 
 
 		 925 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  40.35 
 
 		 289 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.21 
 
 		 603 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  42.42 
 
 		 538 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 		 617 aa  153  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  37.83 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 		 882 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  39.27 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  38.57 
 
 		 820 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  38.74 
 
 		 929 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  38.02 
 
 		 527 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  37.18 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  37.85 
 
 		 892 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  39.63 
 
 		 636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 		 616 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  39.3 
 
 		 877 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  30.33 
 
 		 781 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  34.33 
 
 		 802 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 		 639 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 		 639 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  36.8 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 740 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  35.16 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 637 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.16 
 
 		 654 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 426 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  38.82 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 		 618 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  39.35 
 
 		 620 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  39.17 
 
 		 593 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  36.4 
 
 		 284 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  38.6 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  35.6 
 
 		 283 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 		 621 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1196 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  35.59 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  35.34 
 
 		 293 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 		 625 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  37.9 
 
 		 1132 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  37.93 
 
 		 862 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  34.47 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 		 623 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  34.57 
 
 		 292 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  32.36 
 
 		 664 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 		 628 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  37.96 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  36.43 
 
 		 398 aa  130  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  35.36 
 
 		 287 aa  130  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  29.51 
 
 		 952 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.77 
 
 		 1104 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  30.14 
 
 		 292 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  30.07 
 
 		 600 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  30.14 
 
 		 292 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  34.71 
 
 		 305 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  30.51 
 
 		 549 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  29.7 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  34.25 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  37.75 
 
 		 253 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  34.06 
 
 		 267 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  36.32 
 
 		 267 aa  123  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  32.64 
 
 		 336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  32.02 
 
 		 584 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  32.79 
 
 		 246 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  32 
 
 		 282 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.61 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 668 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.81 
 
 		 398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.86 
 
 		 751 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.99 
 
 		 586 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.32 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  32.16 
 
 		 288 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.26 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  33.58 
 
 		 282 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  33.94 
 
 		 446 aa  114  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  36.69 
 
 		 251 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  31.28 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  36.49 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.1 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>