More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2593 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1454  ABC peptide/nickel/opine transporter, fused ATPase subunits  57.91 
 
 		 617 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4048  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  70.5 
 
 		 612 aa  866    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821009  normal  0.479182 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7269  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  78.02 
 
 		 614 aa  961    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4009  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  69.49 
 
 		 615 aa  856    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3753  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  69.83 
 
 		 612 aa  863    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0979148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2593  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 608 aa  1231    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0103  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.91 
 
 		 617 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0117419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.3 
 
 		 617 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  37.12 
 
 		 611 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  39.69 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  39.41 
 
 		 619 aa  379  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  37.22 
 
 		 611 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  35.45 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  36.25 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  39.18 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  36.24 
 
 		 619 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.74 
 
 		 611 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.42 
 
 		 620 aa  363  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  35.83 
 
 		 612 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  36.08 
 
 		 601 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  37.26 
 
 		 599 aa  362  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  34.35 
 
 		 564 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  38.6 
 
 		 593 aa  360  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 632 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  39.15 
 
 		 592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  35.38 
 
 		 615 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.32 
 
 		 610 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  36.84 
 
 		 664 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 		 539 aa  355  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  37.42 
 
 		 640 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  37.46 
 
 		 640 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  38.51 
 
 		 592 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  38.51 
 
 		 592 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  36.4 
 
 		 597 aa  353  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  37.08 
 
 		 611 aa  353  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 		 539 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  36.3 
 
 		 550 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  36.56 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 		 633 aa  351  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.38 
 
 		 623 aa  350  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  37.11 
 
 		 630 aa  350  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  36.51 
 
 		 611 aa  349  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.2 
 
 		 612 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 627 aa  349  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  37.2 
 
 		 612 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 		 623 aa  349  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  37.35 
 
 		 629 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 		 623 aa  349  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 623 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 		 649 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  37.61 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.25 
 
 		 626 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 		 625 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  38.02 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  38.02 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  37.55 
 
 		 593 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 		 623 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 		 633 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.12 
 
 		 633 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  36.56 
 
 		 633 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  35.94 
 
 		 543 aa  346  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.5 
 
 		 619 aa  346  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 		 543 aa  346  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 623 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 623 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  39.66 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.42 
 
 		 625 aa  344  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 		 629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.44 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  36.51 
 
 		 569 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  37.09 
 
 		 571 aa  343  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.2 
 
 		 634 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.2 
 
 		 634 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  38.92 
 
 		 550 aa  343  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  36.51 
 
 		 562 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.2 
 
 		 634 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  37.54 
 
 		 624 aa  342  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  41.11 
 
 		 539 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  39.48 
 
 		 534 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 623 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.12 
 
 		 629 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  38.22 
 
 		 595 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  36.72 
 
 		 623 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  35.18 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  37.06 
 
 		 573 aa  341  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  40.82 
 
 		 540 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.5 
 
 		 632 aa  339  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  37.76 
 
 		 530 aa  339  8e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  35.44 
 
 		 552 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.46 
 
 		 643 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 541 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  35.69 
 
 		 631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  40.82 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  36.79 
 
 		 537 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  37.74 
 
 		 640 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  40.63 
 
 		 540 aa  336  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.64 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.56 
 
 		 536 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>