More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1700 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  100 
 
 
148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  81.08 
 
 
148 aa  255  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  82.43 
 
 
148 aa  253  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  81.08 
 
 
148 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  79.73 
 
 
148 aa  249  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  77.7 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  77.7 
 
 
148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.7 
 
 
147 aa  197  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.43 
 
 
149 aa  196  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  63.38 
 
 
204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  61.9 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.41 
 
 
146 aa  187  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.83 
 
 
158 aa  186  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.46 
 
 
173 aa  186  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0476  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.68 
 
 
145 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  64.14 
 
 
151 aa  185  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.89 
 
 
171 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.83 
 
 
158 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0521  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.27 
 
 
145 aa  183  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  60.14 
 
 
149 aa  183  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.76 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.83 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.83 
 
 
147 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.14 
 
 
147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.34 
 
 
164 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  64.06 
 
 
150 aa  174  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1908  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.31 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.2 
 
 
162 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  53.52 
 
 
148 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.93 
 
 
142 aa  164  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0449  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  50.7 
 
 
140 aa  154  6e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  52.03 
 
 
152 aa  153  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.69 
 
 
149 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  58.27 
 
 
174 aa  150  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.17 
 
 
146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  51.35 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  48.97 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  51.35 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  56.15 
 
 
159 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0469  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  50 
 
 
135 aa  140  7e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.94 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.95 
 
 
152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0573  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.89 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  48.98 
 
 
205 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.85 
 
 
189 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.81 
 
 
151 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.68 
 
 
231 aa  136  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.11 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  47.55 
 
 
170 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 
170 aa  136  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.67 
 
 
153 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
182 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  49.65 
 
 
200 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
182 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  49.33 
 
 
151 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  49.65 
 
 
187 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 
176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  48.25 
 
 
165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  45.58 
 
 
177 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  49.65 
 
 
200 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2267  hypothetical protein  64.91 
 
 
150 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0504375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 
150 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
461 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0941  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.91 
 
 
150 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180946  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.3 
 
 
148 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.15 
 
 
177 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.85 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.22 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.89 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  47.95 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.26 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  45.07 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.14 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.92 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  49.65 
 
 
168 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  46.85 
 
 
161 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  46.15 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.97 
 
 
363 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.95 
 
 
168 aa  130  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.25 
 
 
166 aa  130  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
175 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  46.85 
 
 
183 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.27 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.06 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
175 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
160 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.92 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.83 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  45.45 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
137 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.18 
 
 
484 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1926  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.81 
 
 
144 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512826  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  45.45 
 
 
155 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.26 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>