51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1075 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1075  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  845    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  30.12 
 
 		 673 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  29.88 
 
 		 696 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  31.1 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  37.21 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  26.47 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  23.66 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  29.89 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 956 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 760 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  23.66 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.12 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  40.58 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 1156 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  27.12 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  28.46 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  25.93 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  28.12 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  34.23 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  36.26 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  23.02 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  26.17 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  21.46 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  21.36 
 
 		 1119 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>