30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0597 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0597  helicase  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  91.86 
 
 		 1437 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  62.34 
 
 		 1435 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  62.82 
 
 		 1474 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  64.1 
 
 		 1446 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  55.42 
 
 		 1459 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  58.97 
 
 		 1451 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  61.54 
 
 		 1440 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  55.7 
 
 		 1439 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  55.7 
 
 		 1439 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  58.75 
 
 		 1459 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  59.26 
 
 		 1448 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  54.32 
 
 		 1449 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  59.26 
 
 		 1447 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  58.75 
 
 		 1455 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  56.41 
 
 		 1440 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  50 
 
 		 1498 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  50 
 
 		 1396 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  68.52 
 
 		 1444 aa  81.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  57.89 
 
 		 1444 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  66.67 
 
 		 1440 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  61.54 
 
 		 896 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  44.71 
 
 		 1463 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  62 
 
 		 1458 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  52.73 
 
 		 1440 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  37.97 
 
 		 1529 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  37.97 
 
 		 1536 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  36.62 
 
 		 611 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  35.21 
 
 		 1413 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  44.9 
 
 		 1421 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>