More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1371 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  83.52 
 
 
94 aa  156  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  83.52 
 
 
94 aa  156  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  83.52 
 
 
94 aa  156  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 
99 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 
99 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  79.12 
 
 
94 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 
103 aa  150  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
103 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
95 aa  140  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  73.63 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  75.82 
 
 
95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  75.82 
 
 
95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  71.74 
 
 
101 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  71.74 
 
 
101 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
93 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  70.65 
 
 
103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  70.65 
 
 
101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  70.65 
 
 
104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
93 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  70.33 
 
 
94 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  70.65 
 
 
101 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  72.53 
 
 
95 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  70.65 
 
 
101 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  71.43 
 
 
100 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  70.33 
 
 
98 aa  130  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  70.65 
 
 
97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  70.33 
 
 
96 aa  130  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  69.23 
 
 
106 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  67.39 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  67.39 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  67.39 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  68.13 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  68.13 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  67.03 
 
 
101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  60.44 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  60.44 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 
94 aa  114  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 
102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  57.14 
 
 
93 aa  110  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 
100 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 
98 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
138 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
137 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 
107 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 
107 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
135 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2563  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 
126 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.160302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  58.24 
 
 
92 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
98 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  54.35 
 
 
98 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 
107 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
95 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 
95 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
92 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
94 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 
108 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 
101 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 
94 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 
101 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 
94 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  53.26 
 
 
95 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 
94 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  51.65 
 
 
95 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 
103 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 
114 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 
103 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1015  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1095  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.939272  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0988  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.165109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000105854  normal  0.266842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1080  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0899853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
95 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000570398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1047  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 
94 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.788464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>