139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43210 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  88.33 
 
 
270 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  90.31 
 
 
286 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  87.94 
 
 
270 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  87.21 
 
 
270 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.66 
 
 
270 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  87.55 
 
 
270 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  84.44 
 
 
270 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.43 
 
 
269 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.76 
 
 
279 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.76 
 
 
279 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  46.67 
 
 
277 aa  244  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.35 
 
 
276 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.02 
 
 
277 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.02 
 
 
277 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  44.31 
 
 
268 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.75 
 
 
268 aa  209  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  46.47 
 
 
271 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  45.76 
 
 
268 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.51 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.16 
 
 
268 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.69 
 
 
268 aa  194  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.19 
 
 
298 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.57 
 
 
277 aa  188  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.86 
 
 
277 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  42.8 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  40.77 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.25 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.41 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  40.24 
 
 
273 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.38 
 
 
277 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  30.57 
 
 
232 aa  59.7  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  30.48 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  26.32 
 
 
224 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  31.48 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1902  uridylate kinase  32.11 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  23.85 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  34.86 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  29.61 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  31.43 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  31.43 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  31.43 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  31.43 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  29.76 
 
 
235 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  23.11 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  31.19 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  30.19 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  29.25 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  29.25 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  29.91 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  28.85 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  29.52 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  29.81 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  28.57 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  27.62 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  30.1 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  24.17 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  24.07 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  26.67 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  26.92 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  30.1 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  31.07 
 
 
235 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  29.52 
 
 
247 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  29.7 
 
 
235 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  25.79 
 
 
241 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  26.54 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  28.3 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  25.32 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  25.79 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  30.28 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  28.04 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  26.85 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  28.85 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  28.3 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  30.48 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  28.07 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  29.63 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  28.16 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  28.16 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  26.97 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  28.16 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  30.1 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  29.25 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  29.25 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  25.91 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  27.87 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  29.13 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  26.42 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  38.6 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  26.21 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  28.57 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  31.48 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  28.16 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  32.97 
 
 
390 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  29.63 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  29.63 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  27.18 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  27.18 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  26.79 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>