More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  69.84 
 
 
493 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2571  ABC transporter  77.24 
 
 
495 aa  774    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22100  ABC transporter protein  100 
 
 
497 aa  1004    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
505 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
493 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  69.84 
 
 
493 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
493 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
493 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2046  ABC transporter related  62.93 
 
 
489 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4583  ABC transporter related  59.84 
 
 
500 aa  571  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  53.85 
 
 
505 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  53.72 
 
 
492 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
486 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 
492 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  46.95 
 
 
494 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  48.18 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0966  ABC transporter related  46.84 
 
 
502 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0912  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 
502 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3881  sugar transport ATP-binding protein  46.64 
 
 
502 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0578526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
525 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  44.51 
 
 
513 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  45.12 
 
 
513 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.99 
 
 
523 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.92 
 
 
513 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  44.98 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  44.35 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  42.77 
 
 
496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.55 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.02 
 
 
524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.9 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.4 
 
 
494 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.06 
 
 
497 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  44.07 
 
 
512 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.96 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
494 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 
494 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.86 
 
 
494 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.85 
 
 
521 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43.24 
 
 
508 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.73 
 
 
501 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.32 
 
 
518 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 
496 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.72 
 
 
498 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  42.48 
 
 
515 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
505 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 
494 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  43.74 
 
 
503 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.67 
 
 
524 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.67 
 
 
524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.66 
 
 
512 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.07 
 
 
524 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.07 
 
 
524 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.55 
 
 
514 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.67 
 
 
524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.66 
 
 
512 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.03 
 
 
503 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
497 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  42.16 
 
 
510 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.46 
 
 
514 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.67 
 
 
524 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.15 
 
 
516 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.94 
 
 
512 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.1 
 
 
496 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  44.58 
 
 
499 aa  389  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
527 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  44.35 
 
 
511 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  44.51 
 
 
509 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.37 
 
 
513 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 
512 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  43.15 
 
 
514 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  42.6 
 
 
513 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.41 
 
 
492 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.07 
 
 
503 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.53 
 
 
516 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  43.79 
 
 
516 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  41.77 
 
 
516 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
501 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  43.62 
 
 
537 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  43.17 
 
 
512 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.02 
 
 
520 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.49 
 
 
511 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.39 
 
 
513 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  43.03 
 
 
508 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.43 
 
 
495 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  41.86 
 
 
510 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.36 
 
 
519 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.45 
 
 
500 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  41.04 
 
 
499 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  42.07 
 
 
513 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  42.28 
 
 
499 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.54 
 
 
503 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.46 
 
 
516 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.07 
 
 
504 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
461 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
525 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>