29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20270 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  71.88 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  68.75 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  61.54 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  71.88 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  51.35 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  56.41 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  58.97 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  58.97 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  54.35 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1354  hypothetical protein  52.38 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  58.97 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5257  hypothetical protein  44.44 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  47.5 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  46.15 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  39.22 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  41.03 
 
 		 104 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  47.06 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  57.58 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  38.89 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1516  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.439073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>