More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  100 
 
 
472 aa  906    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  60.16 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  44.07 
 
 
455 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  44.07 
 
 
457 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  44.07 
 
 
457 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
454 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
454 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  39.08 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  45.01 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  36.56 
 
 
471 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  36.34 
 
 
471 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  38.26 
 
 
449 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  35.7 
 
 
478 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  35.7 
 
 
478 aa  249  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.09 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
433 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  36.03 
 
 
519 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
458 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
433 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.34 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
450 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  35.4 
 
 
438 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
445 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  35.06 
 
 
438 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
438 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
448 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02325  signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280945  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
466 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1229  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
477 aa  210  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.131746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
413 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
448 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  35.49 
 
 
448 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  32.62 
 
 
449 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
448 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
448 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
480 aa  200  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  31.59 
 
 
471 aa  199  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  38.96 
 
 
501 aa  199  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  32.2 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  32.41 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  32.2 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0769555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  32.41 
 
 
449 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  32.41 
 
 
449 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  32.41 
 
 
449 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  30.74 
 
 
476 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  32.41 
 
 
449 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  31.68 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
466 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
465 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
465 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
464 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  36.21 
 
 
459 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  32.2 
 
 
449 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  36.72 
 
 
455 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
465 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
462 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32.49 
 
 
442 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  36.1 
 
 
475 aa  193  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  30.09 
 
 
465 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
517 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  39.3 
 
 
449 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  33.07 
 
 
411 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.75 
 
 
513 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
461 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  40.33 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  40.33 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.4 
 
 
499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
515 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 
519 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  40.33 
 
 
505 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  40.33 
 
 
505 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
515 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  40.53 
 
 
517 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  34.18 
 
 
467 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003618  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
475 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  32.71 
 
 
449 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
524 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
459 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
459 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
459 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  36.86 
 
 
523 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
459 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  36.86 
 
 
518 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
459 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  34.31 
 
 
452 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  31.34 
 
 
487 aa  186  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3359  sensor protein QseC  32.7 
 
 
449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>