More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5360 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  82.15 
 
 		 594 aa  1020    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  56.23 
 
 		 607 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  58.66 
 
 		 599 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  57.84 
 
 		 592 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 594 aa  1220    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  59.36 
 
 		 594 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  56.38 
 
 		 594 aa  638    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  60.27 
 
 		 600 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  81.48 
 
 		 593 aa  1003    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  55.85 
 
 		 593 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  51.23 
 
 		 624 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  51.56 
 
 		 609 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  52.16 
 
 		 601 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  52.31 
 
 		 615 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  53.17 
 
 		 597 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  50.82 
 
 		 616 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  48.37 
 
 		 613 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  50.08 
 
 		 612 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  51.1 
 
 		 601 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  37.13 
 
 		 642 aa  319  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 643 aa  293  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  34.86 
 
 		 573 aa  293  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  34.59 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  36.7 
 
 		 630 aa  290  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  34.59 
 
 		 570 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  34.59 
 
 		 570 aa  290  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  35.13 
 
 		 570 aa  289  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  34.77 
 
 		 570 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  34.59 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  34.41 
 
 		 570 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 		 570 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 		 570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  33.61 
 
 		 593 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  34.41 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 586 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.98 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  32.5 
 
 		 565 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.62 
 
 		 563 aa  266  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.26 
 
 		 564 aa  260  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  32.68 
 
 		 579 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  33.79 
 
 		 562 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  31.74 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  30.95 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  30.66 
 
 		 561 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.5 
 
 		 565 aa  236  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.95 
 
 		 541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  31.91 
 
 		 553 aa  233  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  31.64 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  31.48 
 
 		 534 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  32.42 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  29.57 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  31.86 
 
 		 543 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  29.57 
 
 		 556 aa  216  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  31.69 
 
 		 533 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.54 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  32.18 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.77 
 
 		 536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  30.54 
 
 		 576 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  32.99 
 
 		 540 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  30 
 
 		 580 aa  214  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  29.44 
 
 		 590 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  29.07 
 
 		 576 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.83 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  34.31 
 
 		 542 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  31.32 
 
 		 558 aa  210  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  28.86 
 
 		 580 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  31.18 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  29.92 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  28.96 
 
 		 581 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  31.57 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  29.51 
 
 		 525 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  30.43 
 
 		 583 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  31.39 
 
 		 533 aa  206  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  29.02 
 
 		 580 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  28.83 
 
 		 580 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  28.83 
 
 		 580 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  29.43 
 
 		 581 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  31.92 
 
 		 531 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  28.83 
 
 		 580 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  32.09 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.75 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  30.94 
 
 		 535 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  28.83 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  28.83 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  29.09 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  30.26 
 
 		 583 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  29.1 
 
 		 581 aa  204  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  28.76 
 
 		 581 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  28.69 
 
 		 580 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  28.76 
 
 		 583 aa  203  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  30.07 
 
 		 545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  27.89 
 
 		 592 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  28.93 
 
 		 577 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  29.46 
 
 		 577 aa  201  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  28.36 
 
 		 580 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  35.53 
 
 		 542 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  29.7 
 
 		 576 aa  200  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  29.89 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  29.68 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>