30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1525 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1525  rhizobiocin/RTX toxin  100 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  30.7 
 
 		 1217 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  42.14 
 
 		 2667 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  30.7 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  34.48 
 
 		 960 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  31.98 
 
 		 1787 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.59 
 
 		 2954 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1880 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  34.04 
 
 		 724 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.97 
 
 		 2885 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.55 
 
 		 855 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3277  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1355  hypothetical protein  35.59 
 
 		 500 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.23 
 
 		 2245 aa  45.8  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 		 623 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  33.54 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1083 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 1789 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  35.78 
 
 		 1844 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  33.88 
 
 		 537 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3855  Hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.4 
 
 		 1895 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.59 
 
 		 1499 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 		 1400 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  41.94 
 
 		 3598 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0469  hypothetical protein  30.77 
 
 		 458 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000719923  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  32.95 
 
 		 959 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  33.82 
 
 		 1112 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.46 
 
 		 2775 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  33.85 
 
 		 1156 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>