284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1401 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  59.14 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  59.5 
 
 		 314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  53.21 
 
 		 308 aa  298  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  38.46 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  31.25 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  27 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.14 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  27.76 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  29.27 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  28.12 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  25.2 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  24.91 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  28.17 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3289  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.13 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  24.15 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  28 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  28.85 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1118  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.08 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.867073  decreased coverage  0.00200137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  27.51 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  26.59 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  27.97 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  30.04 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  29.03 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  27.23 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  27.03 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  27.8 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.38 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  26.74 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3762  diacylglycerol kinase  28.57 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.91 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  26.83 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  33.61 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  33.61 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  24.71 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  28.03 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  24.6 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  29.27 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  25.34 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  28.24 
 
 		 335 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2771  diacylglycerol kinase  27.43 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148668  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  33.54 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.82 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  28.38 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  25.9 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  27.27 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  25.09 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  32.91 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  29.22 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  23.74 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  27.45 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  38.61 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  28.29 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3375  diacylglycerol kinase  27.97 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3437  diacylglycerol kinase  27.97 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00697361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3386  diacylglycerol kinase  27.97 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  30.23 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0390  bmrU protein  25.56 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  23.14 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  28.29 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  40.7 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2655  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.32 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  32.37 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  38.53 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2441  diacylglycerol kinase catalytic region  28.57 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  25.96 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  38.53 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  30.11 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  27.27 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3383  diacylglycerol kinase catalytic region  29.93 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  24.83 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  32.81 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  23.74 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  39.18 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  37.61 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0890  diacylglycerol kinase catalytic region  28.46 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  28.22 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  33.33 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.6 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  30.71 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.35 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.35 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.35 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  26.97 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  37.63 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  29.93 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  22.99 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1398  diacylglycerol kinase catalytic region  46.15 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5857  hypothetical protein  27.6 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  24.42 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0894  diacylglycerol kinase catalytic region  28.36 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495381  normal  0.488234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3028  diacylglycerol kinase catalytic region  29.15 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  32 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  31.37 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  30.3 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0766  diacylglycerol kinase catalytic region  27.44 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0749  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.44 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.868968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  35.78 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  24.07 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.37 
 
 		 489 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>