32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1315 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1315  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.25781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  50 
 
 		 330 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  43.1 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  41.07 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  39.66 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  37.7 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  39.66 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  42.59 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  39.68 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 285 aa  42.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1086  rare lipoprotein A  39.29 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.463128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 1910 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  40.74 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  39.51 
 
 		 301 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 567 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  36.67 
 
 		 143 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  48.08 
 
 		 183 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  33.67 
 
 		 546 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  44.12 
 
 		 590 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0950  hypothetical protein  45.83 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40.3 
 
 		 335 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 546 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0157  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.59 
 
 		 353 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 		 160 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>