More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2656 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  84.14 
 
 		 472 aa  791    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  100 
 
 		 470 aa  939    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  55.4 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  54.25 
 
 		 518 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  56.37 
 
 		 482 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  54.88 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  55.27 
 
 		 439 aa  435  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  54.42 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  52.36 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  54.7 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  54.4 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  50.89 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  49.43 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  49.53 
 
 		 452 aa  349  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  48.81 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 467 aa  338  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  48.18 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  48.69 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  48.7 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  39.89 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  33.57 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  33.65 
 
 		 485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  34.61 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  32.46 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  32.22 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.24 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.72 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  34.68 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.01 
 
 		 896 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.52 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.6 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.72 
 
 		 416 aa  206  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.16 
 
 		 406 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.53 
 
 		 408 aa  205  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.95 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  31.36 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.5 
 
 		 417 aa  203  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.14 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.99 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  33.93 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.6 
 
 		 426 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.65 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  32.69 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.68 
 
 		 414 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  35.57 
 
 		 393 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.11 
 
 		 435 aa  199  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.69 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  34.78 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.69 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  36.01 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  35.75 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.8 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  34.41 
 
 		 880 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.8 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  33.95 
 
 		 879 aa  196  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  34.92 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  32.59 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.03 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  31.27 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.46 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.37 
 
 		 421 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  31.32 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.95 
 
 		 414 aa  192  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  33.61 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.37 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.72 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.27 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  34.05 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.17 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.78 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  32.98 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.41 
 
 		 417 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  31.94 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.41 
 
 		 417 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  34.59 
 
 		 878 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.7 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.35 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.61 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  33.51 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.86 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  34.29 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.25 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  32.38 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.04 
 
 		 417 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.05 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.46 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.24 
 
 		 885 aa  189  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  33.77 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.7 
 
 		 425 aa  189  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.15 
 
 		 419 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.25 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.44 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.12 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.1 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>