29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2006 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  808    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  79.56 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  71.6 
 
 		 418 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  55.07 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  24.47 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  27.84 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2714  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0501546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  23.81 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  30.5 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  35.87 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  31.17 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>