44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1513 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  63.62 
 
 		 640 aa  658    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1282    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  40.92 
 
 		 633 aa  228  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  39.08 
 
 		 936 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  38.39 
 
 		 750 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  51.5 
 
 		 918 aa  196  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  50.25 
 
 		 355 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  48.36 
 
 		 339 aa  187  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  56.17 
 
 		 788 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  47.18 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  46.89 
 
 		 618 aa  177  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  45.87 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  50.5 
 
 		 753 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  53.63 
 
 		 350 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  50.52 
 
 		 321 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  39.58 
 
 		 621 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  44.49 
 
 		 277 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  44.09 
 
 		 277 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  44.09 
 
 		 277 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  43.81 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  44.67 
 
 		 274 aa  150  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.06 
 
 		 675 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  48.73 
 
 		 374 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  40.93 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  47.52 
 
 		 250 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  48.22 
 
 		 341 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  45.54 
 
 		 285 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1079 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  35.14 
 
 		 658 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  54.37 
 
 		 286 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  43.59 
 
 		 654 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  49.01 
 
 		 227 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  33.01 
 
 		 591 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  31.56 
 
 		 543 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  47.34 
 
 		 245 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  46.7 
 
 		 200 aa  110  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  38.36 
 
 		 1131 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.66 
 
 		 854 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  33.19 
 
 		 985 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1171  pseudouridine synthase Rsu  32.87 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0907  pseudouridine synthase Rsu  37.5 
 
 		 743 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1701  putative pseudouridine synthase, Rsu  34.36 
 
 		 690 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  40.7 
 
 		 689 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  39 
 
 		 736 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>